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No evidence for three functionally specialized subregions in the subthalamic nucleus.tar.gz (238.05 GB)

No evidence for three functionally specialized subdivisions in the subthalamic nucleus

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dataset
posted on 11.12.2020, 12:57 by S. Miletić
Dataset 2 for:
Miletic et al. (2020). No evidence for three functionally specialized subdivisions in the subthalamic nucleus.

Directory tree:
├── all_subjects_confounds_ds-02.pkl
├── all_subjects_events_ds-02.pkl
├── all_subjects_stn_timeseries_ds-02.pkl
├── behavior_ds-02.csv
├── BMAParameters_ds-02.csv
├── both <----- 3rd level GLM (based on both datasets)
│ └── glm_level3
│ ├── cope10.gfeat
│ ├── cope11.gfeat
│ ├── cope12.gfeat
│ ├── cope13.gfeat
│ ├── cope14.gfeat
│ ├── cope15.gfeat
│ ├── cope1.gfeat
│ ├── cope2.gfeat
│ ├── cope3.gfeat
│ ├── cope4.gfeat
│ ├── cope5.gfeat
│ ├── cope6.gfeat
│ ├── cope7.gfeat
│ ├── cope8.gfeat
│ ├── cope9.gfeat
│ ├── fsfs
│ ├── third_level_design_dmc.con
│ ├── third_level_design_dmc_cov.png
│ ├── third_level_design_dmc_cov.ppm
│ ├── third_level_design_dmc.fsf
│ ├── third_level_design_dmc.grp
│ ├── third_level_design_dmc.mat
│ ├── third_level_design_dmc.png
│ └── third_level_design_dmc.ppm
└── ds-02
├── conjunct_masks <----- STN masks in MP2RAGE-ME space
│ ├── sub-01
│ ├── sub-02
│ ├── sub-03
│ ├── sub-05
│ ├── sub-06
│ ├── sub-07
│ ├── sub-08
│ ├── sub-09
│ ├── sub-10
│ ├── sub-11
│ ├── sub-12
│ ├── sub-13
│ ├── sub-14
│ └── sub-15
├── extracted_signal <----- STN signal
│ ├── sub-01
│ ├── sub-02
│ ├── sub-03
│ ├── sub-05
│ ├── sub-06
│ ├── sub-07
│ ├── sub-08
│ ├── sub-09
│ ├── sub-10
│ ├── sub-11
│ ├── sub-12
│ ├── sub-13
│ ├── sub-14
│ └── sub-15
├── feat_files <----- First&Second-level GLM files
│ ├── sub-01
│ ├── sub-02
│ ├── sub-03
│ ├── sub-05
│ ├── sub-06
│ ├── sub-07
│ ├── sub-08
│ ├── sub-09
│ ├── sub-10
│ ├── sub-11
│ ├── sub-12
│ ├── sub-13
│ ├── sub-14
│ └── sub-15
├── fmriprep <----- Output from fmriprep
│ ├── dataset_description.json
│ ├── desc-aparcaseg_dseg.tsv
│ ├── desc-aseg_dseg.tsv
│ ├── freesurfer
│ ├── logs
│ ├── sub-01
│ ├── sub-01.html
│ ├── sub-02
│ ├── sub-02.html
│ ├── sub-03
│ ├── sub-03.html
│ ├── sub-05
│ ├── sub-05.html
│ ├── sub-06
│ ├── sub-06.html
│ ├── sub-07
│ ├── sub-07.html
│ ├── sub-08
│ ├── sub-08.html
│ ├── sub-09
│ ├── sub-09.html
│ ├── sub-10
│ ├── sub-10.html
│ ├── sub-11
│ ├── sub-11.html
│ ├── sub-12
│ ├── sub-12.html
│ ├── sub-13
│ ├── sub-13.html
│ ├── sub-14
│ ├── sub-14.html
│ ├── sub-15
│ └── sub-15.html
├── fmriprep_data <----- Input for fmriprep (bids-formatted unprocessed (but defaced and MP2RAGE background noise removed) data)
│ ├── dataset_description.json
│ ├── sub-01
│ ├── sub-02
│ ├── sub-03
│ ├── sub-05
│ ├── sub-06
│ ├── sub-07
│ ├── sub-08
│ ├── sub-09
│ ├── sub-10
│ ├── sub-11
│ ├── sub-12
│ ├── sub-13
│ ├── sub-14
│ ├── sub-15
│ └── task-randomdotmotion_bold.json
├── freesurfer
│ ├── fsaverage
│ ├── fsaverage5
│ ├── sub-01
│ ├── sub-02
│ ├── sub-03
│ ├── sub-05
│ ├── sub-06
│ ├── sub-07
│ ├── sub-08
│ ├── sub-09
│ ├── sub-10
│ ├── sub-11
│ ├── sub-12
│ ├── sub-13
│ ├── sub-14
│ └── sub-15
└── pca_masks <----- PCA'd masks in T1w-space
├── sub-01
├── sub-02
├── sub-03
├── sub-05
├── sub-06
├── sub-07
├── sub-08
├── sub-09
├── sub-10
├── sub-11
├── sub-12
├── sub-13
├── sub-14
└── sub-15

History

Retention period

31/12/2030

Research priority area

  • Brain & Cognition

Licence

Exports

University of Amsterdam / Amsterdam University of Applied Sciences

Categories

Licence

Exports